ويوفر المسح الجيني من الفطريات التي تعيش على الجلد إطارا لفهم كيفية مساهمة هذه الجراثيم على صحة الجلد والأمراض.
تعيش المجتمعات معقدة من الميكروبات الموجودة على سطح أجسامنا. هذه الفطريات والبكتيريا والفيروسات والتي تعرف باسم microbiome الجلد. وقام فريق من معهد المعاهد الوطنية للصحة الوطني لأبحاث الجينوم البشري (NHGRI) والمعهد الوطني للسرطان (NCI) المستخدمة سابقا التقنيات الجينومية لدراسة البكتيريا الجلد. ووجد الباحثون المجتمعات البكتيرية المختلفة التي تنوعت بين الناس والموقع الجلد. في الدراسة الجديدة، استخدم فريق نهجا الجيني مماثلة للحصول على فهم أفضل للفطريات التي تعيش على الجلد.
وتشمل الفطريات قوالب، والفطر، والخميرة التي تستخدم لتخمر الخبز والجعة. وقد ارتبطت هذه الميكروبات مع العديد من الأمراض والأمراض الجلدية، بما في ذلك قدم الرياضي، والأكزيما والقشرة والتهابات أظافر. الالتهابات الجلدية الفطرية تؤثر على ما يقدر ب 29 مليون شخص في البلاد. ولكن الفطريات يمكن أن تكون بطيئة وصعبة لتنمو في المختبرات، مما يجعل العدوى الفطرية من الصعب تحديد ومعالجة.
في مايو 22 ، 2013 ، جمع العلماء عينات في مواقع الجسم 14 من البالغين الأصحاء 10. وقد ركزوا على جزء من الحمض النووي تشارك فيه جميع الفطريات - وهو الفاصل الداخلي المتقاطع (1) (أي إس إس إن إن إكس إكس) الخاص بالحمض النووي الريبوزي Ribosomal - والذي يمكن استخدامه لتصنيف الفطريات على مستوى الجنس بأكثر من دقة 1٪.
من خلال توليد أكثر من 5 مليون تسلسل ITS1 من العينات ، تمكن الفريق من التعرف على أكثر من أنواع فطرية من نوع 80 تعيش على الجلد البشري. في المقابل ، يمكن لطرق الاستنبات التقليدية تحديد أنواع 18 فقط. تم العثور عليها في جميع مواقع الجلد. كان النوع السائد على 11 لمواقع 14 ، بما في ذلك خلف الأذنين ، في الخياشيم ، على الظهر ، وعلى الذراعين.
وجد الفريق أن الكعبين ، اللذان لا يظهران تنوعًا كبيرًا للبكتيريا ، كانا الموقع الأكثر تعقيدًا للفطريات ، مع تمثيل أنواع 80. كانت شبكات إصبع القدم ، مع أنواع 60 ، والأظافر ، مع 40 ، أعلى المستويات التالية من التنوع الفطري. الأيدي والأذرع ، التي تؤوي مجموعة كبيرة من البكتيريا ، لديها أنواع قليلة نسبيا من الفطريات. كانت المجتمعات الفطرية على الجسم الأساسي مستقرة تمامًا بمرور الوقت ، مع تغير بسيط عند اختبارها لفترات 3 على حدة. في المقابل ، تغيرت الفطريات على القدمين بشكل كبير خلال الأشهر 3 ، وربما تعكس المزيد من التعرض البيئي.
"المجتمعات الفطرية على جسم الإنسان معقدة ومحددة الموقع" ، ويقول المؤلف المشارك كبار الدكتور هايدي كونج من NCI. من خلال اكتساب وعي أكثر اكتمالاً للأنظمة البيئية الفطرية والبكتيرية ، يمكننا معالجة الأمراض الجلدية المصاحبة بشكل أفضل ، بما في ذلك العدوى الفطرية ، والتي يمكن أن ترتبط بمعالجة السرطان.
تقول لنا الدكتورة جولي سيغري من مؤسسة NHGRI أن البيانات الواردة من دراستنا تعطينا خط الأساس حول الأفراد العاديين الذين لم يكن لدينا من قبل. خلاصة القول هي أن قدميك تعج بالتنوع الفطري ، لذلك عليك ارتداء زحافاتك في غرف خلع الملابس إذا كنت لا ترغب في خلط فطريات القدم مع فطريات شخص آخر.
